Kocaeli Üniversitesi Teknoloji Transfer Ofisi A.Ş., tüzel kişiliğin temsil edildiği ve akademisyenlerden oluşan bir Yönetim Kurulu ve bu kurula bağlı bir müdürün koordinatörlüğünde faaliyetlerini sürdürmektedir.

Şirket yapısı, Teknoloji Transfer Ofisi temel faaliyetlerini belirleyen toplamda 5 (beş) modül ve bu modüllerin eksiksiz sürdürülebilmesi için idari, hukuki ve mali süreçlerin takip edildiği birimlerden oluşmaktadır.